Atapuerca, lo que nos dice el ADN de los restos encontrados

 

Fósiles en la Sima de los Huesos. Fuente: Fundación Atapuerca
 

El conjunto arqueológico y paleontológico de la sierra de Atapuerca (provincia de Burgos) constituye uno de los enclaves más relevantes del mundo para el estudio de la evolución humana en la Península Ibérica y en toda Eurasia durante el Pleistoceno.

 1. Historia del yacimiento

El descubrimiento científico de Atapuerca estuvo ligado a la construcción de una trinchera de ferrocarril minero a finales del siglo XIX, la cual cortó varios karst fósiles y dejó al descubierto galerías colmadas de sedimentos con fósiles y herramientas de piedra. Seguidamente podemos considerar cuatro fechas clave en Atapuerca:

  •     1976: El ingeniero de minas Trinidad de Torres rescata restos de oso de las cavernas y fósiles humanos en la Sima de los Huesos, entregándolos al paleontólogo Emiliano Aguirre.
  •     1978: Se inician los trabajos de excavación sistemática bajo la dirección de Emiliano Aguirre.
  •     1990: Juan Luis Arsuaga, José María Bermúdez de Castro y Eudald Carbonell asumen la codirección de las excavaciones, periodo en el que suceden los descubrimientos más emblemáticos.
  •     2000: La UNESCO declara a Atapuerca Patrimonio de la Humanidad.

 2. Principales simas y hallazgos paleoantropológicos

Los diferentes yacimientos de la sierra ofrecen una secuencia cronológica excepcional que abarca más de un millón de años:

  •     Sima del Elefante (~1,2 - 1,4 millones de años): Alberga algunos de los restos de homínidos más antiguos de Europa occidental (entre ellos, una mandíbula parcial hallada en 2007 y un fragmento facial descubierto en 2022).
  •     Gran Dolina (~800.000 años): En el nivel TD6 se hallaron en 1994 los restos que sirvieron para definir la especie Homo antecessor, caracterizada por una combinación única de rasgos faciales modernos y dentición arcaica, además de evidencias directas de canibalismo.
  •     Sima de los Huesos (~430.000 años): Una cavidad interior que alberga una acumulación extraordinaria de más de 7.000 fósiles humanos pertenecientes a al menos 29 individuos, acompañados del bifaz "Excalibur".
  •     Galería de las Estatuas y Cueva Fantasma: Yacimientos clave para comprender la presencia de Neanderthales en fases posteriores del Pleistoceno medio y superior.

 

3. Revelaciones de la genética fósil (ADNmt y ADN nuclear/ADN-Y)

Atapuerca ha sido pionera en el análisis del paleogenoma gracias al avance en las técnicas de extracción de ADN fósil degradado. Veamos seguidamente algunas revelaciones importantes.
 

1. Sorpresa mitocondrial (ADNmt)

En 2013, la secuenciación del ADN mitocondrial (maternamente heredado) de un fémur de la Sima de los Huesos (~430.000 años) reveló una coincidencia genética inesperada: el ADNmt de estos fósiles estaba más estrechamente emparentado con los denisovanos (población arcaica asiática) que con los neandertales europeos clásicos.

2. Confirmación nuclear y ADN del linaje masculino (ADN-Y)

En 2016, la obtención de ADN nuclear —que incluye secuencias del cromosoma Y (ADN-Y) y el genoma autosómico— aportó la clave definitiva: los homínidos de la Sima de los Huesos pertenecían claramente a la línea evolutiva neandertal (Homo heidelbergensis / neandertales tempranos).

La divergencia entre la señal mitocondrial y la nuclear se explica por un fenómeno de introgresión genética o reemplazo mitocondrial: los neandertales posteriores reemplazaron su linaje de ADNmt original por otro linaje procedente del tronco africano (cercano al linaje de Homo sapiens), mientras que la Sima de los Huesos conserva la señal mitocondrial arcaica previa a ese evento de hibridación.

3. ADN ambiental en sedimentos

Análisis recientes en la Galería de las Estatuas permitieron recuperar ADN neandertal directamente del sedimento (sin necesidad de hueso), demostrando un reemplazo poblacional de linajes neandertales en Europa central-occidental hace unos 100.000 años.

 4. Especies de homínidos identificadas

  •     Homo sapiens / Homo antecessor (1,4 millones de años – 800.000 años): Primeras oleadas de poblamiento europeo.
  •     Neandertales tempranos / Homo heidelbergensis (~430.000 años, Sima de los Huesos): Antepasados directos de los neandertales clásicos.
  •     Homo neanderthalensis (Pleistoceno Superior): Ocupantes de varias cavidades del complejo kárstico.

 

El enigma: Dos genomas, dos historias distintas

El enigma genético de la Sima de los Huesos (Atapuerca, ~430.000 años) supuso un punto de inflexión en la paleogenómica. La discordancia entre su ADN mitocondrial (ADNmt) y su ADN nuclear puso de manifiesto un complejo escenario de eventos de hibridación e introgresión genética entre distintos linajes de homínidos durante el Pleistoceno Medio.   

Para comprender el reemplazo mitocondrial, es fundamental diferenciar cómo se heredan ambos tipos de material genético:

ADN nuclear (autosómico y cromosoma Y): Se hereda de ambos progenitores, sufre recombinación en cada generación y constituye la inmensa mayoría del genoma, reflejando la historia filogenética global de la especie.

ADN mitocondrial (ADNmt): Se hereda exclusivamente por vía materna, no recombina y evoluciona únicamente por acumulación de mutaciones puntuales a lo largo de las generaciones.

Cuando el equipo del Max Planck Institute recuperó por primera vez ADNmt de un fósil de la Sima de los Huesos en 2013, los resultados mostraron que su linaje materno estaba estrechamente emparentado con el de los denisovanos (población arcaica que habitó Siberia y Asia oriental). Sin embargo, la morfología ósea de los fósiles de Atapuerca mostraba claros rasgos proto-neandertales.   

Años más tarde (2016), tras lograr extraer ADN nuclear de la Sima de los Huesos, la paradoja se resolvió: su genoma nuclear confirmó de forma categórica que los homínidos de Atapuerca eran neandertales tempranos, compartiendo un antepasado común mucho más reciente con los neandertales tardíos de Europa que con los denisovanos. Recordemos que los denisovanos son un grupo extinto de humanos arcaicos o homininos, parientes cercanos de los neandertales, que vivieron en Asia y Siberia hace entre 1 millón y 40.000 años.

Retrato robot de un denisovano

 El mecanismo: ¿Cómo ocurrió el reemplazo del ADNmt?

El fenómeno que explica esta discrepancia es la introgresión genética con reemplazo mitocondrial completado. La secuencia de acontecimientos reconstruida por los paleogenetistas se resume en los siguientes pasos:   

Fase A: El linaje arcaico compartidoLos neandertales y los denisovanos divergieron de un ancestro común (a menudo asociado a Homo heidelbergensis / Homo rhodesiensis) hace aproximadamente 500.000–600.000 años. La población ancestral que dio lugar a los proto-neandertales europeos (entre ellos, los de la Sima de los Huesos) y a los denisovanos asiáticos poseía un linaje mitocondrial ancestral de tipo "denisovano".   

Fase B: Hibridación con un linaje procedente de África   En algún momento posterior a la época de los homínidos de Atapuerca (hace entre 300.000 y 100.000 años), un grupo de homínidos procedentes de África —estrechamente emparentados con la rama que daría origen al Homo sapiens moderno— migró hacia Eurasia e interactuó con las poblaciones neandertales europeas.   

Durante estos encuentros se produjeron eventos de hibridación (cruzamiento entre especies o poblaciones diferenciadas). Un número reducido de hembras pertenecientes a este linaje afro-moderno o "sapiens arcaico" se integró en las comunidades neandertales.

 


 Fase C: Fijación y deriva genética

El ADNmt procedente del grupo "afro-sapiens" ingresó en el acervo genético neandertal. Debido al pequeño tamaño efectivo de las poblaciones neandertales en Europa (propensas a cuellos de botella demográficos y deriva genética) o bien por una posible ventaja selectiva de la nueva variante mitocondrial, el antiguo ADNmt de tipo "denisovano" se extinguió progresivamente en Europa.  Con el tiempo, el nuevo ADNmt introducido por introgresión reemplazó por completo al linaje mitocondrial original en casi todas las poblaciones neandertales tardías del Pleistoceno Superior (como los fósiles neandertales hallados en Vindija, El Sidrón o Feldhofer).  

 4. Conclusiones sobre el patrón genético resultante

Gracias a la conservación del ADN en la Sima de los Huesos, se pudo comprobar que la historia evolutiva de los homínidos eurasiáticos no consistió en ramas aisladas, sino en una red compleja de poblaciones interconectadas con episodios periódicos de flujo genético.

Iruzkinak